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Identificción de indicadores de origen de tumores

NR5A2 indicador de riesgo del cáncer de páncreas | IMDEA Alimentación

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AÑO: 2018.

CLIENTE: Investigador Centro Nacional Investigaciones Oncológicas.

TECNOLOGÍA: Aplicación de algoritmos bioinformáticos y técnicas de cluster.

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Necesidad abordada y beneficio aportado

Asesoramiento, procesamiento, análisis y explotación de datos de expresión obtenidos mediante técnicas de secuenciación.

Descripción

Se asesoró en el diseño de los experimentos de secuenciación como la selección de librerías. Se llevaron a cabo los análisis de calidad de las lecturas, filtrado, alineamiento, contajes, análisis de expresión diferencial y utilización de métodos de «clustering» como el análisis de componentes principales para la explotación e interpretación de los resultados obtenidos. La estrategia de minado de los datos permitió identificar el gen NR5A2 como uno de los genes que aumenta el riesgo de desarrollar cáncer de páncreas y que además se ocupa también de controlar la inflamación en el tejido normal. Este hallazgo implicó un importante cambio conceptual ayudando a entender mejor el origen de los tumores. Los resultados fueron publicados en la revista «Nature».

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